中华口腔医学会成立于 1996 年 11 月 17 日，是在民政部注册的唯一的国家一级全国性口腔医学学术团体，由国家卫生健康委员会业务主管，是中国科学技术协会的团体会员。2013 年被民政部评为 5A 级社会组织并获得中国科协“学会能力提升专项”优秀科技社团三等奖。2015 年获中国科协“学会创新和服务能力提升工程优秀科技社团建设项目” 二等奖，2017 年获“全国科协系统先进集体”，2018 年获中国科协“世界一流学会建设项目（二类）”及全国学会 9 星级优秀党组织，2020 年获得中国科协“优秀抗疫学会”、“优秀扶贫学会”和“优秀科技志愿服务队”。中华口腔医学会是三大国际口腔医学学术组织——世界牙科联盟（FDI）、国际牙科研究会 （IADR）、国际牙医师学院 （ICD） 的团体会员，已成为全球口腔医学领域中的重要成员。
